清代地方行政組織為省、道、府 (直隸州、廳)、縣 (散州、散廳) 四級。此外，還有與省大體平行的邊疆特別行政區。

鴉片戰爭前，設18行省，后增臺灣、新疆、奉天、吉林、黑龍江5省。最高長官是總督和巡撫，每一省或二、三省設總督，各自均設巡撫。他們都是皇帝的心腹。每省還設有提督學政一人，與督撫平行。督撫之下，設承宣布政使司和提刑按察使司，各設使一人。布政使又稱藩臺，主管一省民政、財政、人事，按察使又稱臬臺，主管一省司法、刑獄，糾察，兼領驛傳。

道設道員，各省無定員。道有分守道與分巡道，分守道專掌錢谷，分巡道專掌刑名，此外還有專職道，是主管一省某一方面事務的，如糧儲道、鹽法道、兵備道、河工道等。

府設知府一人，上隸于省，下督率所屬州縣官。全國有215府。州分散州 (屬州)、直隸州二種，設知州一人 (又稱刺史、州牧)。散州隸于府，轄區較縣大，級別與縣同，直隸州與府同級 (無屬縣)，直屬于省。

廳一般設在邊遠地區，分屬 (散) 廳、直隸廳二種，設同知或通判一人。屬廳隸于府，直隸廳與府同級，隸于省。

縣設知縣 (又稱縣令、縣尹) 一人，是為臨民官，主管一縣政事。清代全國共有縣1358個。

清代的基層政權組織是保甲。不論城鄉，十戶一牌，十牌一甲，十甲一保，各立長一人。每戶門上掛一印牌，上寫戶主名和丁口數，并登入官冊。戶口遷移，需注明來往處所。佃戶、雇工或附于牌甲之末，或附于本戶之下，如有造反，實行連坐。還有與保甲制相表里的里甲制，系因襲明代，是專管賦役的基層組織。