內(nèi)閣與六部： 內(nèi)閣是中央最高行政機(jī)構(gòu)，設(shè)內(nèi)閣大學(xué)士4人(滿(mǎn)、漢各2人)，協(xié)辦大學(xué)士滿(mǎn)、漢各1人、學(xué)士滿(mǎn)6人、漢4人。六部是中央政府的執(zhí)行機(jī)關(guān)，各部皆設(shè)尚書(shū)為長(zhǎng)官，左、右侍郎為副長(zhǎng)官，俱滿(mǎn)、漢各1人。所屬各司長(zhǎng)官為郎中，副長(zhǎng)官為員外郎。

議政王大臣會(huì)議和軍機(jī)處： 它們是清代真正的最高權(quán)力機(jī)構(gòu)。清初，軍國(guó)大政，皆交由議政王大臣會(huì)議決定，成員完全是滿(mǎn)人，漢人不得參預(yù)。康熙時(shí)，為削弱內(nèi)閣和議政王大臣會(huì)議的權(quán)力，在宮內(nèi)設(shè)南書(shū)房，負(fù)責(zé)擬寫(xiě)皇帝諭旨。雍正時(shí)始設(shè)軍機(jī)處，取代議政王大臣會(huì)議，剝奪了諸王預(yù)政的權(quán)力。軍機(jī)大臣由皇帝在滿(mǎn)、漢大學(xué)士及各部尚書(shū)、侍郎中選定，下設(shè)章京等官，從六部員司和內(nèi)閣中書(shū)里選用或從中央機(jī)關(guān)調(diào)用。章京也是滿(mǎn)、漢各兩班，每班8人，一人領(lǐng)班。

理藩院： 管理少數(shù)民族事務(wù)的中央機(jī)構(gòu)，其編制與六部同，正副長(zhǎng)官亦稱(chēng)尚書(shū)、侍郎，全由滿(mǎn)、蒙人擔(dān)任，漢人不得參預(yù)。

都察院負(fù)責(zé)監(jiān)察、彈劾官吏，長(zhǎng)官為左都御史，滿(mǎn)、漢各一人，副長(zhǎng)官為左副都御史，滿(mǎn)、漢各二人。大理寺為最高法院，正副長(zhǎng)官為寺卿和少卿，滿(mǎn)、漢各一人。通政司掌收受各省題本及臣民密封申訴件，設(shè)通政使、副使、參議，俱滿(mǎn)、漢各一人。

此外，有翰林院 (御用秘書(shū))、詹事府 (皇帝文學(xué)侍從)、國(guó)子監(jiān) (最高學(xué)府)、欽天監(jiān) (掌天文歷法)、宗人府 (掌皇族)、內(nèi)務(wù)府 (宮中之事)、太常寺 (掌祭祀)、光祿寺 (外廷宴會(huì))、鴻臚寺 (殿廷禮儀)、太仆寺 (馬政)、太醫(yī)院 (為皇族醫(yī)院)，各寺、府、院設(shè)有卿、少卿，滿(mǎn)、漢各一人。