萬歷元年正月的一天，正是早朝時分，神宗出乾清宮，看到一男子倉皇走過，命手下把他抓住，從他身上搜出刀子，便將他帶到東廠審問。此人供稱王大臣，原是個逃兵。馮保認定這是個絕好的機會，想乘機徹底除去高拱，便哄騙王大臣，若供認是高拱要他謀刺皇帝，就放了他，以后還有重賞，若不依便要拷打至死。王大臣只好如此這般招供了一番。謀刺皇上是何等罪名，若此案成立，那就不僅是高拱一家的問題了，因此朝士人人自危。由于張居正與馮保關系密切，大家都懷疑張居正也參與了陰謀，自嘉靖以來，首輔之爭都是血淋淋的，嚴嵩殺了夏言，徐階殺了嚴世蕃，高拱又使徐階的兒子充軍。有威望的大臣葛守禮約楊博同去求張居正，楊說： “已經和他說過了?！?守禮說： “楊公為眾望所歸，認為只有您能不殺人媚人。大獄將起，怎能以已說過為理由推托呢?” 于是葛、楊共見居正，急切地以全家百口擔保高拱，楊博說： “愿相公持公議，扶元氣。東廠人哪有良心，若大獄起株連眾人，如何結果就不得而知了?！?居正憤憤地說： “兩位以為我也甘心高公嗎?” 楊博說： “只是認為非相公不能回天罷了?！?于是，張居正設法令東廠與錦衣衛會審，左都御史葛守禮也參與其間。葛守禮叫高拱仆人混入軍校之中，讓王大臣來辯認，而他不能認出。會審時，王大臣翻供，馮保問：“你上回說是高拱指使，是怎么回事?”犯人說：“是你教我的，我怎么認識高相國呢?”參加會審的大臣說：“你要誣蔑法官嗎?”趕快中止審問。當晚，有人給王大臣灌下一杯生漆酒，使他變成了啞巴，案子就變成了無頭案。當事者趕快將王大臣殺了，不再追查。而所謂清議仍懷疑張居正，后高拱的《病榻遺言》一口咬定此案為張、馮共同策劃的。