為對付日漸嚴重的倭難，嘉靖二十六年，朝廷任命朱紈為浙江巡撫，兼管浙閩軍事。朱紈到任，推行嚴厲的海禁政策，下令將所有雙檣的海船全部銷毀，違者斬首，并積極練兵，嚴格糾察，抓到勾結倭寇的奸商，立刻斬首。當時通倭的大都是有權勢的豪強官家，朱紈的措施使他們惴惴不安，便通過各種途徑攻擊他專權濫殺，致使朱紈罷官待審，面對盤根錯節的閩浙勢家，他哀嘆說： “去外國盜易，去中國盜難，去中國瀕海之盜猶易，去中國衣冠之盜尤難。” 他憤而自殺。此后提起防海大事，朝野人士都搖手不敢開口，海盜更加猖獗。嘉靖三十一年，朝廷又派王忬總領軍事，他重用俞大猷、湯克寬等將領，數次擊敗倭寇，并派密探搜捕內奸，沿海為內應的豪強一掃而光，使倭寇失去了耳目。嘉靖三十三年，張經代替王忬總督東南諸省軍務。張經積極練兵，又從兩廣調來狼士兵，在沒作好準備之前，他下令不許輕戰。三十四年，倭寇大舉進犯，杭州被圍，數十里外，血流成河。這時，嚴嵩的親信趙文華來浙，崇信道教的世宗派他來祭海求平倭難，并讓他監督軍務。趙文華下車伊始，便催促張經趕快出擊，張經自以為官位比他高，沒把作戰計劃告訴他，趙文華便告了刁狀，說張經畏敵不前，想等敵人逃走后再殺余寇請功。世宗聽信，下令逮捕張經，令未到，張經已打了大勝仗。狼士兵到達浙江后，張經令幾路明軍合擊嘉興以北的一伙海盜，把其趕至王江涇中，斬首二千多級，溺水而死者無數，取得了抗倭以來的第一個大勝仗。這時許多官員都認為不宜更換主帥，可昏庸的皇帝聽從嚴嵩的胡言，認為張經是被彈劾才勉強出戰的，這次大捷是趙文華督師有功才取得的，竟然賞賜趙文華，而仍將張經等下獄，不久將他斬首。